W grze dostępne są dwie drogi rozwoju postaci:

-Możemy być złym ninja, w tedy mamy zły charakter możemy opuścić wioskę (od rangi jounin) i przystąpić do  organizacji lub założyć swoja własną organizacje, i być przeciwko naszej ojczyźnie.

-Możemy być dobrym ninja, wtedy to nie możemy opuścić wioski, ale otwiera nam się droga do stania Hokage.